2010年8月,人力資源和社會保障部聯合全國博士后管理委員會批準我院設立博士后科研工作站(人社部發〔2010〕60號)。我院與中國科學院大學、中國石油大學(北京)、中國地質大學(武漢)、北京林業大學、重慶大學等10余所高校流動站建立聯合招收合作機制,累計招收培養博士后37名。博士后在站期間獲中國科協青年人才托舉工程、香江學者計劃、中國博士后基金特別資助、留學歸國創新創業項目、重慶市博士后研究項目特別資助等國家、省部級人才資助50余項。
院建立了博士后導師專家庫,目前在庫導師26名(客座導師2名),其中包括國務院特殊津貼獲得者、自然資源部科技領軍人才、重慶市有突出貢獻的中青年專家、重慶市學科帶頭人、重慶市百名工程技術高端人才、重慶市科技創新領軍人才、重慶市技術技能領軍人才等省部級科技名號人才。